A opção fica em "Configurações CWP" / "Editar php.ini", conforme tela abaixo.

Quando o php.ini é editado através painel CWP, este simplesmente grava o arquivo na pasta public_html.  Caso prefira, poderá editar o php.ini diretamente na pasta public_html.

Detalhes em: https://docs.control-webpanel.com/docs/user-guide/cwp-settings/edit-php-ini